Il Museo di Arte Antica occupa le sale degli appartamenti ducali, la dimora milanese di Galeazzo Maria Sforza e di Bona di Savoia dal 1468, collocati al piano terra della Corte Ducale. Alcuni ambienti coperti da eleganti volte a padiglione conservano, anche se ampiamente restaurate, le antiche decorazioni dipinte. La terza sala del Museo, la Cappella di San Donato, presenta sulla volta una Resurrezione di Cristo, commissionata probabilmente da Galeazzo Maria Sforza ed eseguita prima del 1477.